AHF inauguró la primera clínica AHF Uganda Cares en el distrito de Masaka en febrero de 2002, gracias a una colaboración con el Ministerio de Salud de Uganda, ofreciendo la primera oportunidad de recibir tratamiento antirretroviral (TAR) fuera de la capital, Kampala, en un centro de salud público: el Hospital Regional de Referencia de Masaka.

 AHF Uganda Cares es uno de los mayores proveedores de servicios gratuitos de VIH en el país, ofreciendo prevención, tratamiento y atención. Su modelo, que integra la participación pública, de la sociedad civil y de la comunidad, fue reconocido como una buena práctica para la terapia antirretroviral por la Organización Mundial de la Salud y ONUSIDA en 2003. Gracias al apoyo intensivo de organizaciones comunitarias, el 98 % de los pacientes cumplen con sus regímenes de tratamiento. A lo largo de los años, el programa se ha expandido para abarcar 28 distritos, incluido Rakai, donde se identificó el primer caso de VIH en Uganda en 1980.

AHF Uganda Cares ofrece terapia antirretroviral gratuita a más de 148,600 personas en todo el país, junto con servicios de asesoramiento y pruebas de VIH específicos para llegar a las poblaciones en riesgo y vincular a los clientes seropositivos con la atención. Las iniciativas de prevención incluyen educación sobre el uso de preservativos, distribución gratuita de preservativos y promoción de sexo seguro mediante campañas de divulgación y en los medios de comunicación.

Las pruebas de detección del VIH están disponibles en los 64 centros de salud que reciben apoyo de AHF, y se complementan con mejoras de infraestructura para crear un entorno de servicio digno para los clientes. Además, AHF Uganda Cares participa en actividades de promoción para promover el acceso al tratamiento, obtener financiación para la respuesta al VIH, proteger los derechos de las niñas y hacer hincapié en el uso del preservativo como método clave de prevención del VIH.